Episódio 1 - A Clear And Present Danger

Meses após a explosão que ocorreu na Pinehearst e na Primatech, os nossos heroes estão a tentar deixar o passado distante ao tentar iniciar uma nova vida.
Hiro Nakamura, ainda sem o seu poder de Teletransporte e Manipulação do Espaço e Tempo, com o seu amigo Ando, estão-se a treinar para se tornarem num verdadeiro herói. O prefessor Mohinder Suresh volta à sua vida como taxista e Peter Petrelli retorna à sua “obsessão” de querer salvar outras pessoas.
Matt Parkman e Daphne tentam viver uma vida normal como qualquer outro casal.
Claire Bennet, embora esteja a tentar viver uma vida normal, fica frustrada quando descobre que existe uma conspiração com o Governo e o seu Pai biológico, Nathan Petrelli, para localizar e deter todos aqueles que tiverem habilidades especiais.
Por outro lado, Sylar parte em busca de encontrar os seus pais verdadeiros.